Nếu một cuộc khảo sát được thực hiện để xem liệu mọi người có tin vào người ngoài hành tinh, người du hành thời gian hay có thể là nhà siêu năng lực hay không, hầu hết sẽ nói rằng họ không tin; học sinh trung học bình thường Kyon tự coi mình là một trong số những người không có đức tin. Tuy nhiên, vào ngày đầu tiên đến trường, anh gặp một cô gái sớm đảo lộn thế giới của anh. Trong buổi giới thiệu lớp, người đẹp Haruhi Suzumiya mạnh dạn bày tỏ sự nhàm chán của mình với những người “bình thường” và ý định gặp gỡ những sinh vật siêu nhiên. Ngẩn ngơ, Kyon biết được sự thất vọng của cô khi thiếu các câu lạc bộ tập trung vào hiện tượng huyền bí ở trường và vô tình truyền cảm hứng cho cô thành lập câu lạc bộ của riêng mình. Cô ấy tạo ra Niềm vui lan tỏa khắp thế giới cùng với Lữ đoàn Haruhi Suzumiya, hay còn gọi là Lữ đoàn SOS. Sau khi thành lập Lữ đoàn SOS, Haruhi tuyển được Kyon và ba thành viên khác: con mọt sách trầm lặng Yuki Nagato, học sinh lớp trên nhút nhát Mikuru Asahina và Itsuki Koizumi luôn lạc quan. Mặc dù có vẻ ngoài bình thường nhưng các thành viên mới của Lữ đoàn SOS đều mang trong mình những bí mật riêng liên quan đến Haruhi. Bị cuốn vào bí ẩn xung quanh người thủ lĩnh câu lạc bộ lập dị, Kyon bị Haruhi và Lữ đoàn SOS lôi kéo vào một loạt rủi ro, mỗi người đều đưa anh đến gần hơn với sự thật về cô ấy là ai và là gì.